Устанавливаем для синхронизации ntp-демон и синхронизируем время:

apt-get install ntp ntpdate
ntpdate -bs ru.pool.ntp.org

Запускаем конфигуратор и выбираем нужные параметры (Europe -> Kiev)

dpkg-reconfigure tzdata

Изменить часовой пояс на сервере весьма просто. Инструкция представлена ниже. Создаем бекап файла localtime

mv /etc/localtime /etc/localtime.bak

Изменяем часовой пояс:

ln -s /usr/share/zoneinfo/Europe/Kiev /etc/localtime

Проверяем время и часовой пояс:

date

Если если время показывает не точное, то можно синхронизировать с NTP-сервером. Устанавливаем NTP:

yum install ntp ntpdate

Ставим в автозагрузку:

chkconfig --level 2345 ntpd on

Запускаем сервис:

service ntpd start

Обновляем информацию с сервера.

ntpdate pool.ntp.org

Вместо pool.ntp.org можно указать любой удобный сервер точного времени. Также есть еще один момент связанный с некорректным отображением времени для городов РФ - в связи с отменой зимнего времени возникла "каша" с часовыми поясами, но вопрос решается просто - обновлением пакета tzdata

yum update tzdata