Error: rpmdb open failed после установки пакетов в ISPmanager 5 Lite

При установке пакетов nginx, alt-php в ISPmanager 5 Lite возникла проблема с базой пакетов rpm, как поломалась — на сервере была очень высокая нагрузка. И да, в разделе «Возможности» было совсем пусто, от слова «the end». При просмотре лога было следующее:

tail -n100 /usr/local/mgr5/var/pkg.log 

Error: rpmdb open failed

*** Wed May  9 01:50:03 EDT 2018
*** installing ispmanager-pkg-nginx
error: rpmdb: BDB0113 Thread/process 10897/47317484890240 failed: BDB1507 Thread died in Berkeley DB library
error: db5 error(-30973) from dbenv->failchk: BDB0087 DB_RUNRECOVERY: Fatal error, run database recovery
error: cannot open Packages index using db5 -  (-30973)
error: cannot open Packages database in /var/lib/rpm
CRITICAL:yum.main:

Error: rpmdb open failed

*** Wed May  9 01:50:04 EDT 2018
*** installing ispmanager-pkg-phpfpm
error: rpmdb: BDB0113 Thread/process 10897/47317484890240 failed: BDB1507 Thread died in Berkeley DB library
error: db5 error(-30973) from dbenv->failchk: BDB0087 DB_RUNRECOVERY: Fatal error, run database recovery
error: cannot open Packages index using db5 -  (-30973)
error: cannot open Packages database in /var/lib/rpm
CRITICAL:yum.main:

Error: rpmdb open failed

При том, что при выполнении в терминале yum update вызывало подобную ошибку

Решение проблемы следующее

cp -R /var/lib/rpm/ ~/rpm_bak/
rm -f /var/lib/rpm/__db*
rpm -vv --rebuilddb
yum clean all

ps: у меня был достаточно свежий сервер, поэтому базы перестроились быстро, но не исключайте фактора, что ребилдится может очень долго